S.cerevisiae - Yeastract

View Consensus in Promoter

Warning! Overlapping consensus sequences found in either strands may not be highlighted correctly!

Standard Name

YNCQ0021W

Promoter Sequence

Consensus
ATATA: -848 -832 -824 -822 -716 -714 -712 -710 -704 -682 -666 -660 -658 -656 -654 -633 -631 -629 -627 -625 -617 -615 -508 -475 -437 -435 -425 -423 -421 -419 -417 -393 -376 -368 -366 -364 -275 -273 -271 -269 -267 -248 -246 -108 -100 -61 -59 -27 -25 -9

>YNCQ0021W    upstream sequence, from -1000 to -1, size 1000
TTTTATATTTATAAATAAATTTATTACTCCTTCTTAATTAAGAATAAAAAGGGATGCGGT
TCCCATGGGGTCCCGCACTCCTTCGGGGTCCGCCCCCTCCCCTGCGGGAGGGGAGCGGAC
TATTTTATTAAAAATATTATAATTAAATAATAATATAAATAATTTATAATATAATAATAT
ATACTTATAAATAATATTTAAATCTTATTATTAATTTATAAATCATAAATTATTATTAAT
AAATATCTCTTTTAGATAAGATAAATTGAACTTATATTTATATTATATAan>TAan>TAan>TAGATAT
AAATCTTAAATAGAGTAAATATATTATAATAATTATATAAATATAan>TAan>TAan>TATTATATTAA
GATAATAATATAan>TAan>TAan>TAan>TATTAATATAan>TAAGGAGGGATTTTCAATGTTGGTAGTTGGAG
TTGAGCTGTAAACTCAATGACTTAGGTCTTCATAGGTTCAATTCCTATTCCCTTCATAAT
TTATTATTAATTATATATTATTATAAATCAAATCCATTGAAATTAATATAATCCAATGAA
TAATTAATTTAATACATAATTTAATATAan>TAAAATTATATAan>TAan>TAan>TAan>TACTTTATAAAAAA
AAAAATTATATAATAATTATATTAATATATTTATATAan>TAan>TAAATAAATAAATAAATAATA
ATAATTATAATTATAATTATAATTAATTAATTAATAAATAAATAATAATTTATATTATCT
TTATAATATAan>TAan>TAan>TAan>TACTTTTATAAAAAAAATATAan>TAAATAATTCTAAAATGTATATT
TCTCCTTTCGGGGTTCCGGCTCCCGTGGCCGGGCCCCGGAACTATTAATAAAATTAATAA
TAAAATAATTATTATCTGTATTTAATAAATTTAATTATAGAGTTATATTTCTATATATTT
ATATATTTATTTATTTATTCTCCTTCCGGAACTAATAAAATATAan>TAAAATAAGGGTTTTT
ATTTATTTAATTAATATAan>TATTTATTCTTTTATATAATAT

Promoter Sequence
Complementary Strand

Consensus
ATATA: -5 -19 -21 -55 -94 -96 -102 -104 -112 -221 -242 -263 -265 -267 -269 -285 -360 -362 -364 -370 -378 -389 -413 -415 -417 -419 -421 -431 -502 -504 -611 -619 -621 -623 -625 -627 -643 -648 -650 -652 -654 -662 -676 -706 -708 -710 -712 -717 -723 -818 -992

>YNCQ0021W	Upstream Sequence Complementary Strand
AAAATATAAATATTTATTTAAATAATGAGGAAGAATTAATTCTTATTTTTCCCTACGCCA
AGGGTACCCCAGGGCGTGAGGAAGCCCCAGGCGGGGGAGGGGACGCCCTCCCCTCGCCTG
ATAAAATAATTTTTATAATATTAATTTATTATTATATTTATTAAATATTATATTATTATA
TATGAATATTTATTATAAATTTAGAATAATAATTAAATATTTAGTATTTAATAATAATTA
TTTATAGAGAAAATCTATTCTATTTAACTTGAATATAAATATAATATAan>TAan>TAan>TATCTATA
TTTAGAATTTATCTCATTTATATAATATTATTAATATATTTATATAan>TAan>TAan>TAATATAATT
CTATTATTATATAan>TAan>TAan>TAan>TAATTATATATTCCTCCCTAAAAGTTACAACCATCAACCTC
AACTCGACATTTGAGTTACTGAATCCAGAAGTATCCAAGTTAAGGATAAGGGAAGTATTA
AATAATAATTAATATAan>TAATAATATTTAGTTTAGGTAACTTTAATTATATTAGGTTACTT
ATTAATTAAATTATGTATTAAATTATATATTTTAATATAan>TAan>TAan>TAan>TATGAAATATTTTTT
TTTTTAATATATTATTAATATAATTATATAAATATAan>TAan>TATTTATTTATTTATTTATTAT
TATTAATATTAATATTAATATTAATTAATTAATTATTTATTTATTATTAAATATAATAGA
AATATTATATAan>TAan>TAan>TATGAAAATATTTTTTTTATATATTTATTAAGATTTTACATATAA
AGAGGAAAGCCCCAAGGCCGAGGGCACCGGCCCGGGGCCTTGATAATTATTTTAATTATT
ATTTTATTAATAATAGACATAAATTATTTAAATTAATATCTCAATATAAAGATATAan>TAAA
TATAan>TAAATAAATAAATAAGAGGAAGGCCTTGATTATTTTATATATTTTATTCCCAAAAA
TAAATAAATTAATTATATAan>TAAATAAGAAAATATATTATA