Yeastract
Please fill in here our
user satisfaction survey
Thank you!
YEASTRACT+ INESC-ID IST IBB
Home > Search by DNA motif > Result > View in Promoter Contact/Credits     Tutorial     Help

 

View Consensus in Promoter

Warning! Overlapping consensus sequences found in either strands may not be highlighted correctly!
Standard Name YNCQ0025W
Promoter Sequence

Consensus
ATATA: -991 -974 -972 -970 -968 -966 -964 -959 -939 -937 -893 -869 -817 -811 -805 -799 -794 -712 -710 -708 -706 -704 -696 -694 -692 -690 -682 -680 -576 -574 -565 -563 -544 -507 -360 -344 -342 -337 -326 -306 -304 -299 -292 -290 -278 -276 -274 -255 -253 -246 -241 -224 -222 -220 -218 -216 -214 -212 -206 -204 -202 -200 -183 -83 -81 -79 -77 -30 -28 -13
>YNCQ0025W    upstream sequence, from -1000 to -1, size 1000
TTATAATAAATATATTATAATAATTAATATAan>TAan>TAan>TAan>TAan>TAATATATTTAATACAAAGAA
AATATAan>TATTATATCTCTTATTTATTTATTTATTAATATTTTAATAAATATAATATTATA
AAAAAAAGTTTATATATTTAGTTCCGGGGCCCGGCCACGGGAGCCGGAACCCCGGTAGGA
GAAATATAAATATAAATATAAATATAATATAAGTTTGGTATTCATTTAATTATATTATTT
AATTAAAAATATTCTAAATAAGAATAAATATCAATAAAGGAGTTATAAATATAan>TAan>TAan>TAan>T
A
TTAATATAan>TAan>TAan>TAAAAATATAan>TATTATTATTAGTTCCCGCTTTGCGGGAACCCCGTAA
GGAGTGAGGGACCCCATGGGAACCGAACCCCTATTTAAGAAGGAGTTTTATTATAATAAA
ATTTATATAan>TATTTAATATAan>TAATTATAAAAATATTATATAATAAATAATAAATAATTAT
TAATAATAAATAAATATAATAATAATATTATAATAAATTTATAAATGATTATAATAAATT
TATATTAATTTTTTATTTTGTAAATACTAAGATTTGAACTTAGATAATATGCACCTAAAA
ACATACATTTTACCATTAAATTATATTTACCTTATTAATTATATAAAATTTATTAAATAT
ATA
ATATATTAATTATATAAAAATTATTAAATAAATATAan>TAATATATTATATAan>TAATTTA
TAATATAan>TAan>TATTATAAATATTATTATATAan>TAAAATATAATATACTACTTATAAAAATAT
ATAan>TAan>TAan>TAan>TAan>TA
AATATAan>TAan>TAan>TAAATAAATATTTTATATATTAAATTAAATAATTATT
AATAAATTTAATTATAAAGTATAATTTTCAATAGGAATATTTATAAGATTATAATAATTA
TATGAATTATTATAATTATATAan>TAan>TAan>TAAATAAATAAAATAATAATTATAATAATTAATA
AGAGTTTTGGATATAan>TATCTGTGGAGTATATATTTTATAA
Promoter Sequence
Complementary Strand

Consensus
ATATA: -7 -9 -22 -24 -73 -75 -77 -79 -97 -177 -179 -196 -198 -200 -208 -210 -212 -214 -216 -218 -249 -251 -268 -270 -272 -286 -288 -293 -300 -322 -331 -338 -356 -374 -455 -540 -559 -568 -570 -572 -674 -676 -686 -688 -690 -698 -700 -702 -704 -706 -765 -863 -865 -926 -931 -933 -953 -960 -962 -964 -966 -968 -985
>YNCQ0025W	Upstream Sequence Complementary Strand
AATATTATTTATATAATATTATTAATTATATAan>TAan>TAan>TAan>TATTATATAAATTATGTTTCTT
TTATATAan>TAATATAGAGAATAAATAAATAAATAATTATAAAATTATTTATATTATAATAT
TTTTTTTCAAATATAan>TAAATCAAGGCCCCGGGCCGGTGCCCTCGGCCTTGGGGCCATCCT
CTTTATATTTATATTTATATTTATATTATATTCAAACCATAAGTAAATTAATATAATAAA
TTAATTTTTATAAGATTTATTCTTATTTATAGTTATTTCCTCAATATTTATATAan>TAan>TAan>TA
>
TAATTATATAan>TAan>TATTTTTATATAan>TAATAATAATCAAGGGCGAAACGCCCTTGGGGCATT
CCTCACTCCCTGGGGTACCCTTGGCTTGGGGATAAATTCTTCCTCAAAATAATATTATTT
TAAATATAan>TAan>TAAATTATATATTAATATTTTTATAATATATTATTTATTATTTATTAATA
ATTATTATTTATTTATATTATTATTATAATATTATTTAAATATTTACTAATATTATTTAA
ATATAATTAAAAAATAAAACATTTATGATTCTAAACTTGAATCTATTATACGTGGATTTT
TGTATGTAAAATGGTAATTTAATATAAATGGAATAATTAATATATTTTAAATAATTTATA
TA
TTATATAATTAATATATTTTTAATAATTTATTTATATATTATATAATATAan>TATTAAAT
ATTATATAan>TAan>TAATATTTATAATAATATAan>TATTTTATATTATATGATGAATATTTTTATA
TATAan>TAan>TAan>TAan>TA
TTTATATAan>TAan>TATTTATTTATAAAATATAan>TAATTTAATTTATTAATAA
TTATTTAAATTAATATTTCATATTAAAAGTTATCCTTATAAATATTCTAATATTATTAAT
ATA
CTTAATAATATTAATATAan>TAan>TAan>TATTTATTTATTTTATTATTAATATTATTAATTAT
TCTCAAAACCTATATAan>TAGACACCTCATATAan>TAAAATATT
w3c xhtml validator w3c css validator