Yeastract
Please fill in here our
user satisfaction survey
Thank you!
YEASTRACT+ INESC-ID IST IBB
Home > Search by DNA motif > Result > View in Promoter Contact/Credits     Tutorial     Help

 

View Consensus in Promoter

Warning! Overlapping consensus sequences found in either strands may not be highlighted correctly!
Standard Name tT(XXX)Q2
Promoter Sequence

Consensus
ATATA: -963 -909 -881 -849 -847 -837 -835 -833 -831 -819 -804 -787 -734 -710 -643 -622 -620 -589 -464 -437 -363 -361 -348 -346 -297 -295 -293 -291 -273 -193 -191 -174 -172 -170 -162 -160 -158 -156 -154 -152 -121 -119 -102 -100 -98 -84 -82 -77 -70 -48 -39 -32 -14
>tT(XXX)Q2    upstream sequence, from -1000 to -1, size 1000
ATAAAAAAAATATTAATAAAATATTATCCCTTAAACTATATAATAAAATTAAATAATAAT
ATTAATTTAATAAATCTTTTATTTAATAATAATATAAATTATATTAAATATTTATAATAA
TATA
TTATTTATAAAATTATAAAATAAATTTATATAan>TAATTCAATATAan>TAan>TAan>TATTAATT
TATATATTTAAATTAAATATAATTAAATAAATAATATAATCGAATTAATATCTCTTTCGA
CCGGATTATTTATTCAATTATTAATAATATAAATAATTAATTTGTATTGAATATAATTTA
TTTAAATATTTTATTATTATTATTATTATTATTATTAATTTATTAATATTAAAGGAAATA
TA
TTTATTATATTATATTATATAan>TATTTTTTATTATTTATATTTATTATTAATATAAATC
ATTGATAATATCTTCTTTTTATTTATTTATTATTATAATTAAAAAAGAATCTTATATTAA
TTAATATTATTTATTTTTTTTTTATTTAATAAATAAATATTATTATATTAAGATAGATAT
A
ATATTATATCTAGATTTAGGAAATATAGGGTTCGAACCTATAATCTTTCGTGTGTAAAA
CGAATGCTATACCAATTAAGCTAATCTCCTTTATAAAATATAan>TACTCCACAGATATAan>TAT
CCAAAACTCTTATTAATTATTATAATTATTATTTTATTTATTTATATAan>TAan>TAan>TAATTATA
ATAATTCATATAATTATTATAATCTTATAAATATTCCTATTGAAAATTATACTTTATAAT
TAAATTTATTAATAATTATTTAATTTAATATAan>TAAAATATTTATTTATATAan>TAan>TATTTAT
ATAan>TAan>TAan>TAan>TAan>TA
TTTTTATAAGTAGTATATTATATTTTATATAan>TAATAATATTTATAAT
ATAan>TAan>TA
TTATAAATTATATAan>TAATATATTATATATTTATTTAATAATTTTTATATAATT
AATATATTATATATTTAATAAATTTTATATAATTAATAAG
Promoter Sequence
Complementary Strand

Consensus
ATATA: -10 -26 -28 -33 -44 -64 -66 -71 -78 -80 -92 -94 -96 -115 -117 -124 -129 -146 -148 -150 -152 -154 -156 -158 -164 -166 -168 -170 -187 -287 -289 -291 -293 -340 -342 -357 -450 -472 -523 -598 -614 -616 -618 -623 -628 -637 -813 -815 -825 -827 -829 -831 -843 -845 -875 -896 -959
>tT(XXX)Q2	Upstream Sequence Complementary Strand
TATTTTTTTTATAATTATTTTATAATAGGGAATTTGATATATTATTTTAATTTATTATTA
TAATTAAATTATTTAGAAAATAAATTATTATTATATTTAATATAATTTATAAATATTATT
ATATAATAAATATTTTAATATTTTATTTAAATATAan>TATTAAGTTATATAan>TAan>TAan>TAATTAA
ATATAan>TAAATTTAATTTATATTAATTTATTTATTATATTAGCTTAATTATAGAGAAAGCT
GGCCTAATAAATAAGTTAATAATTATTATATTTATTAATTAAACATAACTTATATTAAAT
AAATTTATAAAATAATAATAATAATAATAATAATAATTAAATAATTATAATTTCCTTTAT
ATA
AATAATATAATATAATATAan>TAan>TAAAAAATAATAAATATAAATAATAATTATATTTAG
TAACTATTATAGAAGAAAAATAAATAAATAATAATATTAATTTTTTCTTAGAATATAATT
AATTATAATAAATAAAAAAAAAATAAATTATTTATTTATAATAATATAATTCTATCTATA
TTATAATATAGATCTAAATCCTTTATATCCCAAGCTTGGATATTAGAAAGCACACATTTT
GCTTACGATATGGTTAATTCGATTAGAGGAAATATTTTATATATGAGGTGTCTATATAan>TA
GGTTTTGAGAATAATTAATAATATTAATAATAAAATAAATAAATATAan>TAan>TAan>TATTAATAT
TATTAAGTATATTAATAATATTAGAATATTTATAAGGATAACTTTTAATATGAAATATTA
ATTTAAATAATTATTAATAAATTAAATTATATATTTTATAAATAAATATAan>TAan>TAan>TAAATA
TATAan>TAan>TAan>TAan>TAan>TA
AAAATATTCATCATATAATATAAAATATAan>TATTATTATAAATATTA
TATAan>TAan>TA
ATATTTAATATAan>TATTATATAATATAan>TAAATAAATTATTAAAAATATATTAA
TTATATAATATAan>TAAATTATTTAAAATATATTAATTATTC
w3c xhtml validator w3c css validator